ABSTRACT
The use of DNA sequences analysis has been an important mean to distinguish and to identify populations of organisms at different levels. By molecular markers several complex organisms have been successful detected in plants for distinct aims. Ribosomal DNA (rDNA) has been used to evaluate genetic variability, microorganism phylogeny and to develop specific primers for detection of plant pathogens in plant tissues. In this study, the objective was to characterize isolates of Colletotrichum gossypii var. cephalosporioides and Colletotrichum gossypii, collected in different regions of Brazil, by analyzing the nucleotide sequence of rDNA regions. ITS1, ITS2, and the intervening 5.8S gene were amplified by PCR and their sequences compared to each other and to those from other species registered in the GenBank. The rDNA of isolates associated with Gossypium spp. showed sequence identities ranging from 96 to 100% in the ITS1 region, 98 to 100% in the 5.8S gene, and 97 to 100% in the ITS2 region. The sequences were submitted to UPGMA analysis, and according to the phylogenetic trees, the C. gossypii var. cephalosporioides and C. gossypii species clustered together along with isolates of Glomerella cingulata from mango and papaya, and thus no distinction could be made between isolates of those organisms.
O uso de sequências de fragmentos de DNA tem sido importante ferramenta para distinguir e identificar populações de organismos em diferentes níveis de variação. Por meio de marcadores moleculares alguns organismos com variações taxonômicas complexas têm sido detectados com sucesso em tecidos vegetais. O DNA ribossomal tem sido utilizado para avaliar variabilidade genética, filogenia de micro-organismo e para desenvolver oligonucleotídeos específicos visando à detecção de fitopatógenos. Nesse estudo o objetivo foi comparar isolados do complexo Colletotrichum, incluindo C. gosssypii var. cephalosporioides e C. gossypii, coletados em diferentes regiões do Brasil, todos associados às sementes de algodão, pela análise de sequências de nucleotídeos de regiões de rDNA. ITS1, ITS2 e o gene 5.8S que foram amplificados por PCR e suas sequências comparadas entre si com outras sequências depositadas no GenBank. O rDNA de isolados associados com Gossypium spp. mostraram identidades de sequências na faixa de 96 to 100% na região ITS1, 98 to 100% na região de 5.8S, e 97 a 100% na região ITS2. As sequências foram submetidas a análise UPGMA, e de acordo com as árvores filogenéticas , C. gossypii var. cephalosporioides e C. gossypii fizeram parte de um mesmo cluster junto com isolados de Glomerella cingulata de manga e mamão, e assim nenhuma distinção pode ser feita entre os isolados destes organismos.
Subject(s)
Phylogeny , DNA, Ribosomal , Base Sequence , Colletotrichum , Plant PathologyABSTRACT
Objetivou-se, neste trabalho, verificar o efeito da temperatura e do período de molhamento foliar no progresso da severidade do oídio Microsphaera diffusa Cke. & Pk., nas cultivares de soja Conquista e Suprema [Glycine max (L.) Merr.]. As plantas foram inoculadas em casa-de-vegetação por agitação de plantas doentes sobre plantas sadias no estádio vegetativo V3. Em seguida foram colocadas, ao acaso, em câmaras de crescimento vegetal, nas temperaturas de 15, 20, 25 e 30°C e períodos de molhamento foliar de 0, 6, 12, 18 e 24 h. Dados da severidade foram utilizados para avaliar o progresso da doença e integrados ao longo do tempo por meio da área abaixo da curva de progresso da severidade (AACPS). Modelos de regressão não-linear foram ajustados para AACPS. O progresso da intensidade do oídio (AACPS) nas cultivares Conquista e Suprema foi favorecido por temperaturas próximas a 23ºC e 24ºC, respectivamente. Períodos de molhamento foliar de 8h proporcionaram o progresso máximo da severidade da doença na cultivar Conquista sob temperatura de 23ºC. Temperaturas próximas de 30ºC e de 15ºC reduziram a intensidade da doença.
In this study the effects of temperature and leaf wetness period in the severity progress of Powdery Mildew Cke. & Pk. in soybean cultivars Conquista and Suprema [Glycine max (L.) Merr.] were evaluated. Plants at the V3 stage were inoculated in greenhouse. Subsequently, they were conditioned into growth chambers at temperatures of 15, 20, 25 and 30°C and leaf wetness periods of 0, 6, 12, 18 and 24 hours. Severity data were integrated in time by the disease progress curve for severity (AUDPCS). Non-linear regression models were adjusted for the disease intensity. Temperatures near 23ºC and 24ºC favored the powdery mildew intensity progress (AUDPCS) in Conquista and Suprema cultivars, respectively. Leaf wetness period of 8 h allowed the maximum progress of the disease in Conquista at temperatures of 23ºC. Temperatures near 30ºC and 15ºC reduced powdery mildew intensity.
ABSTRACT
A avaliação da qualidade fisiológica de lotes de sementes de Sesbania virgata é dificultada pela dormência inerente à espécie, bem como pela inadequação metodológica de testes disponíveis. Para desenvolver procedimentos adequados à avaliação da qualidade das sementes de S. virgata, foram avaliados métodos tanto para quebra de dormência como para realização do teste de tetrazólio. Em uma primeira fase, as sementes de cinco lotes foram submetidas a tratamentos para quebra de dormência: lixa, ácido e corte do tegumento, previamente ao teste de germinação. Para caracterização dos lotes e adequação da metodologia do teste de tetrazólio, na segunda fase, as sementes foram lixadas na região oposta ao eixo embrionário, e submetidas aos seguintes testes: tetrazólio, germinação, velocidade de emergência, peso de matéria fresca e de matéria seca de plântulas. Foram utilizados dois métodos de pré-condicionamento: embebição em papel por 18 h a 30 ºC e imersão em água por 12 h a 30 ºC e três períodos (uma, duas e três horas) de imersão em solução de tetrazólio 0,5%. Na análise do perfil dos lotes de S. virgata foram detectadas variações na qualidade fisiológica pelos resultados dos testes de vigor e germinação. O método de escarificação com lixa possibilitou a quebra de dormência das sementes de S. virgata,e o pré-condicionamento das sementes em papel com embebição em solução de tetrazólio 0,5% por duas horas é um procedimento adequado para avaliação da viabilidade das sementes.
The evaluation of Sesbania virgata seed physiological quality is hampered by its intrinsic seed dormancy and inadequate methodologies among available tests. To develop an adequate procedure to evaluate S. virgata seed quality, methods for dormancy breaking and tetrazolium test accomplishment were evaluated. In a first stage, seeds from five lots were submitted to dormancy breaking methods: sandpaper, acid and tegument cuts, followed by germination tests. To characterize lots and adapt a tetrazolium-test, in a second stage, seeds were sanded in the area opposite to the embryonic axis and submitted to the following tests: tetrazolium, germination, vigor index, fresh and dry weight. Two preconditioning conditions (soaked paper for 18 h at 30 ºC and immersion in water for 12 h at 30 ºC) and three immersion timespan (one, two and three hours) in tetrazolium solution 0.5% were used. In the S. virgata lot profile analysis, variations were detected in its physiological quality according to vigor index and germination results. Scarification method with sandpaper better broke S. virgata seed dormancy, and preconditioning seeds in soaked paper followed by immersion in tetrazolium solution for two hours was the appropriate procedure to assess seed viability.